故事围绕一群以御刀祓除“荒魂”的神社巫女“刀使”。她们一边提高个人技能，一边在就读全国五处完全中学。她们隶属差人组织的特别祭祀机动队，驱除称为“荒魂”的神秘敌对生物，履行守护大众的职责。
胎动篇(第1话-第12话)
卫藤可奈美在御前比赛遇上十条姬和。姬和突然袭击刀剑类管理局局长折神紫，获可奈美协助，得以逃离。
随事态发展，她们与柳濑舞衣、糸见沙耶香、益子薰、古波藏爱莲会合，与组织“舞草”合作，打倒被荒魂附体的折神紫。
波澜篇(第13话-第24话)
折神紫被打倒后，关东经常出现荒魂。可奈美与其他刀使四出战斗以祓除荒魂，但有神秘人物夺去“NORO”，其中1人是狮童真希，主角们因此被卷入一连串事件。