本作开辟的次要概念是“回归原点”，整体系统比先前的作品变得简单化。自机的选择也变回只有博丽灵梦及雾雨魔理沙两名角色可用，并且恢复了自从《东方永夜抄～.》一作以来就废除了的装备选择，而且装备选择更增至3种。而故事模式一如以往，都是有4个难度和全部6关，并且达成一定条件后可以开放模式挑战。
上下左右键自机移动
主菜单
键低速移动(低速移动时将改变攻击方式)
Z键射击
X键Bomb(灵击)
ESC键暂停、暂停解除
Ctrl键跳过对话
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